Por volta da segunda metade do século XIX, no bairro Babilônia, interior de São Carlos, Deus por sua imensa bondade e providência, em meio ao povo simples do sítio, quis manifestar seus mistérios. Neste bairro rural, por uma tarde de agosto de 1866, lavrou pavoroso incêndio num pequeno trecho de mata adjacente a uma invernada junto ao córrego de igual nome – Babilônia, o fogo em pouco tempo se estendeu por todo o território e consumiu tudo que encontrava.

Alguns transeuntes rurais que nesta região viviam, rapidamente após o desastre, se dirigiram até o lugar, mais de 10 alqueires de mata virgem da fazenda de Santa Maria de Babilônia consumidos pelo pavoroso fogo. Triste era aquela visão, só se podia ver cinzas e tições que ainda fumegavam. A aflição tomava conta daqueles pobres roceiros, tudo parecia estar perdido, mas eis que de longe e avistaram uma arvore verde, imediatamente foram ao encontro. Ao se aproximarem, uma grande surpresa, não era possível de imediato acreditar, mas a árvore estava verde e vicejante como nunca vista, em seu tronco encontrava-se uma singela imagem de Nossa Senhora da Conceição. Tudo alí, a imagem e a arvore ficaram intactas...O milagre aconteceu.

Em sua honra foi erguida em 1870 a primeira capela, onde muitos fieis começaram a receber graças, por intercessão de Nossa Senhora Aparecida da Babilônia.

A tradição passou a ser mais forte a partir da década de 1940, foi construída uma capela ainda maior, para acomodar os devotos que vinham da região.

Localizada no quilômetro 136 da Rodovia Dr. Paulo Lauro (SP-215), que liga São Carlos a Descalvado. A tradição perdurou e hoje, o Santuário recebe romarias e procissões ao longo de todo ano; e no dia 15 de agosto, dia da Assunção, data escolhida próxima a da sua aparição, acontece a grande festa dos devotos em honra a Senhora Aparecida da Babilônia, como ficou carinhosamente conhecida e titulada até os dias de hoje.